gegangen war

had gone

→ gehen
phrase Rare #29,349
had gone Past perfect form of gehen with sein. It refers to someone having gone or left before another past event. Common in written or narrative German.
GE: Als er sah, dass Paul gegangen war, trat Richard ins Zimmer.
EN: When he saw that Paul had gone, Richard entered the room.

Und nachdem er gegangen war?

And after he left?

— Psycho (1960)

Tom hat mir nicht gesagt, warum er nach Australien gegangen war.

Tom didn't tell me why he had gone to Australia.

Nachdem er gegangen war, hatte sie geweint.

She cried after he left.

Ich hatte nicht bemerkt, dass Tom gegangen war.

I hadn’t noticed that Tom had left.

Tom hätte gerne gewusst, wo Maria aufs Gymnasium gegangen war.

Tom would have liked to know where Maria went to high school.

Das hättest du uns sagen müssen, als Tom noch nicht gegangen war.

You should have told us that while Tom was still here.

Als er sah, dass Paul gegangen war, trat Richard ins Zimmer.

When he saw that Paul had left, Richard entered the room.

Kaum dass Tom gegangen war, machte sich Maria an den nächsten heran.

As soon as Tom left, Maria approached the next one.