had disappeared
Se habían hundido o habían desaparecido.
They had sunk or disappeared.
Cuando yo regresé, habían desaparecido las monedas.
When I returned, the coins had disappeared.
— Pinocho (2019)
Antes tenía dos marcas de nacimiento; casi habían desaparecido.
I used to have two birthmarks; they had almost disappeared.
El tiempo y el espacio habían desaparecido.
Time and space had disappeared.
— El tigre y el dragón (2000)
Otros dos barcos de dos mástiles habían desaparecido sin dejar rastro.
Two more two-masted ships had vanished without a trace.