были неприятности

had trouble

→ быть
phrase Rare #34,581
had trouble Used with у + genitive to say that someone had trouble or problems: у него были неприятности means “he had trouble.”
RU: У Анны были неприятности на работе.
EN: Anna had trouble at work.

Том не хочет, чтобы у него снова были неприятности.

Tom doesn't want to get into trouble again.

Я не хотел, чтобы у Тома были неприятности.

I didn't want Tom to get into trouble.

Том не хотел, чтобы у Мэри были неприятности.

Tom didn't want Mary to get into trouble.