にはほとんど水が

there is hardly any water in …

→ に
phrase Rare #38,619
there is hardly any water in … ほとんど means “hardly any” when used with a negative. には marks the place being discussed.
JA: このタンクにはほとんど水が残っていない。
EN: There’s hardly any water left in this tank.

コップにはほとんど水がありません。

There is hardly any water in the glass.

その池にはほとんど水がない。

There is hardly any water in that pond.

その災害の後、島にはほとんど水が残っていなかった。

After the disaster, there was almost no water left on the island.

井戸にはほとんど水がなかった。

There was hardly any water in the well.

この瓶にはほとんど水がない。

There’s hardly any water in this bottle.