は分かりませんが

I don't know ..., but

→ は
phrase Uncommon #18,141
I don't know ..., but The は marks what the speaker doesn't know; the specific information is usually stated before this phrase. 分かりません is polite.
JA: 理由は分かりませんが、今日は早く帰ります。
EN: I don't know why, but I'm going home early today.

それ以上のことは分かりませんが、

I don't know anything beyond that, but...

— ミスティック・リバー (2003)

何故かは分かりませんが、本当です

I don't know why, but it's true.

— パンズ・ラビリンス (2006)

何かが起こるんです何かは分かりませんが起こります

Something is going to happen. I don't know what, but it will.

— フィールド・オブ・ドリームス (1989)